于丹是中国这10年里最为成功的明星学者，她凭借在《百家讲坛》讲《论语》而名声大噪，但同时也带来极大非议。老梁曾在电视节目中痛批于丹：就是一种心理按摩，就跟灌迷魂汤麻醉剂差不多。她最著名的一次事件是当年在北大被学生哄下台。北大百年讲堂的戏曲精品演出，十个古稀艺术家，几十段经典唱段，精彩纷呈。演出结束后主办方邀于丹上台谈观后感，结果还未开口有学生高呼于丹你下去吧，众人响应起哄，于丹只说了一句把所有敬意都留给老艺术家们就尴尬下台。
据说理由是因为于丹当天很不合时宜地穿着短裙、黑丝、高跟鞋就上来了，实在不太尊重且有碍观瞻。
于丹后来接受媒体采访时回应：我不生气，这事我想通了。于丹说，台下有两种声音：一边起哄；一边在喊：于老师，我爱你。讲完后是一片掌声。为什么事后媒体没写赞扬声？只写嘘声？我是教传媒的，了解媒体：狗咬人不是新闻，人咬狗是新闻。
成名后的于丹特别注重仪表，她参加一个企业论坛，穿着短裙和黑丝，在12月的北京寒冬绽放出招牌式的侧目微笑。她以诗词开场，传递生活之美，核心思想是人要学会平衡。
还有一次参加某活动时，她里面穿着白色超短裙，外面披个透明纱裙，全程露着美腿，在场观众看得瞠目结舌，很难想象这是一个学者的穿着。
去年在南京参加文化活动，因为打扮得像贵妇人再次受到网友争议。她甚至和影视明星一样打扮得花枝招展，走起了时尚活动的红毯。面对这些年来广泛的争议，于丹回应说：我从不把自己当成是学者，我是个女人，我也爱美，我更愿意说自己是一个中国传统文化的普及者和传播者。我该做的事情还得做，该喜欢的不会改变，我知道自己是谁，大家也会知道。